Sa construction s'étend sur trois siècles, de 1175 à 1481. L'une des particularités de l'édifice est de posséder une horloge astronomique.
Réalisée à la du fin 16ème siècle, celle-ci indique la date, les positions de la lune, du soleil et de la Terre, ainsi que celle des étoiles au-dessus de Lyon. La date donnée sera exacte jusqu'en 2019.
Compte tenu des connaissances de l'époque, c'est le soleil qui tourne autour de la Terre !
La cathédrale Saint-Jean présente également des vitraux remarquables datant du début du 12e siècle.
La rosace centrale de la façade est particulièrement admirable.