Le musée cultive sa spécificité méditerranéenne avec, notamment, une salle consacrée à la Provence.
Une autre salle est consacrée à la zoologie mondiale. Elle présente des espèces naturalisées, dont certaines sont très rares, comme le grand lézard de Nouvelle-Zélande.
A voir également, la salle de préhistoire régionale, ainsi que l'aquarium.
Sur rendez-vous, le museum donne accès à la bibliothèque scientifique, constituée d'ouvrages et de revues dans le domaine de l'histoire naturelle.