Afin d'asseoir son pouvoir, le Seigneur Hyctère fait construire, au Xe siècle, un château fort. Au début du XIIe siècle, le Comte de Beaujeu, Seigneur du Beaujolais, fait ériger, à l'emplacement du château de bois, un château fort en pierre.
C'est ce château que nous connaissons aujourd'hui, situé au centre du village.
Pour mettre un terme aux nombreux conflits opposant la lignée des Comtes de Beaujeu à l'Archevêché de Lyon, en 1132, le Pape Innocent II ordonne la démolition du château. Cependant, celle-ci n'aura pas lieu. En 1298, Guichard de Beaujeu, surnommé « Le Grand », fait don de la seigneurie de Lissieu à l'Archevêché de Lyon.
Durant des siècles, le château a constitué une véritable forteresse, et les habitants du village se relayaient pour en assurer la garde.
En 1771, le Seigneur de Lissieu, Anne Nicolas Mermier, trouvant la demeure trop vétuste, fit construire le château de la Roue pour y transférer la seigneurie.